Tugas Komputasi
Perbandingan
Aktivasi Geometri (panjang ikatan dan besar sudut) CH3SH menggunakan WebMo(Gamess)
dengan computional chemistry (Colby/edu/chemitry.html)
Dari hasil perhitungan
webmo di dapat bahwa ketujuh jenis basis
set yang digunakan (minimal, basic, routine dan accurate, MNDO,AM1 dan PM3)
memperlihatkan panjang ikatan ikatan yang berbeda namun perbedaan nilainya
tidak terlalu besar. Nilai dari optimasi geometri tersebut akan dibandingkan
dengan ekseperimen yang telah dilakukan sebelumnya. Optimasi geometry pada
senyawa CH3SH dengan basis set yang berbeda-beda adalah sebagai berikut :
Tabel1.
Tabel perbandingan nilai energi ,Panjang
Ikatan dan Sudut dari senyawa CH3SH
(perhitungan dengan Webmo(Gamess))
|
Basis Set
|
Energy(Hartree)
|
Panjang Ikatan
|
Bond Angle
|
|
Minimal (Basis
STO-3G)
|
-432.9204934355
|
C1-S2 1.8436236
C1-H4 1.0846577
C1-H5 1.0855351
C1-H6 1.0855351
S2-H3 1.3544186
|
H3-C1-S2
97.0152939
H4-C1-S2 110.0006967
H5-C1-S2 109.6802531
H6-C1-S2
109.6802531
|
|
Basic ( 3-21G)
|
-435.5245597196
|
C1-S2 1.9021705
C1-H4 1.0778646
C1-H5 1.0765149
C1-H6 1.0765149
S2-H3 1.3507508
|
H3-C1-S2 98.3346099
H4-C1-S2 109.4177250
H5-C1-S2 107.8520489
H6-C1-S2
107.8520489
|
|
Routine (
6-31G(d))
|
-437.6980901536
|
C1-S2 1.8258113
C1-H4 1.0806682
C1-H5 1.0789213
C1-H6 1.0789213
S2-H3 1.3244467
|
H3-C1-S2 98.2885304
H4-C1-S2 111.1476924
H5-C1-S2 109.0277547
H6-C1-S2 109.0277547
|
|
Accurrate (
6-311+G(d,p)
|
-437.7408190519
|
C1-S2 1.8264053
C1-H4 1.0814115
C1-H5 1.0810692
C1-H6 1.0810692
S2-H3 1.3284137
|
H3-C1-S2 98.3436353
H4-C1-S2 110.4448621
H5-C1-S2 109.0627542
H6-C1-S2 109.0627542
|
|
Basis MNDO
R-MNDO
|
-15.2051835424
|
C1-S2 1.7197765
C1-H4 1.1061407
C1-H5 1.1073342
C1-H6 1.1073342
S2-H3 1.3018208
|
H3-C1-S2 102.7370878
H4-C1-S2 112.5069822
H5-C1-S2 109.8618009
H6-C1-S2 109.8618009
|
|
Basis MNDO
R-AM1
|
-13.8770440815
|
C1-S2 1.7589025
C1-H4 1.1103976
C1-H5 1.1137048
C1-H6 1.1137048
S2-H3 1.3198835
|
H3-C1-S2 99.8875685
H4-C1-S2 112.7648017
H5-C1-S2 108.8138778
H6-C1-S2 108.8138778
|
|
PM3
|
-13.4690494983
|
C1-S2 1.8052379
C1-H4 1.0940044
C1-H5 1.0964974
C1-H6 1.0964974
S2-H3 1.3057329
|
H3-C1-S2 100.2811162
H4-C1-S2 114.2638378
H5-C1-S2 109.9458117
H6-C1-S2 109.9458117
|
o
Total electronic energy =
-438.7541286572 Hartrees
o
antara C1 dan S2 =1.851 ang
o
antara C1 and H4 =1.101 ang
o
antara C1 and H5 =1.101 ang
o
antara C1 and H6 =1.101 ang
Bond
Angle :
o
untuk H4-C1-S2 =106.0 deg
o
untuk H5-C1-S2 =111.1 deg
o
untuk H6-C1-S2 =111.2 deg
o
untuk
H3-S2-C1 =96.73 deg
Dari hasil data yang
diperoleh pada tabel 1 dapat dilihat bahwa nilai panjang ikatan pada setiap
basis set hanya berbeda sedikit atau tidak terlalu besar. Begitu pula dengan
nilai bond angle yang diperoleh berdasarkan hasil data dari tabel 1 hanya
memiliki perbedaan pada basis set MNDO R-MNDO dan PM3 pada ikatan S2-C1-H3 yang
memiliki besar sudut lebih besar dari basis set lainnya. Namun hasil data yang
diperoleh tersebut hampir mendekati dengan hasil data dengan eksperimen
(Colby/edu/chemitry.html).
